Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbsnQ80Y56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RbsnQ80Y56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RbsnQ80Y56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbsnQ80Y56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms