Protein–RNA interactions for Protein: Q80U12

Sgsm2, Small G protein signaling modulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm2Q80U12 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm2Q80U12 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgsm2Q80U12 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sgsm2Q80U12 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms