Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rpap1Q80TE0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rpap1Q80TE0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpap1Q80TE0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rpap1Q80TE0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms