Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2lQ7TS74 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms