Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SugctQ7TNE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SugctQ7TNE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms