Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sbno2Q7TNB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno2Q7TNB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sbno2Q7TNB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms