Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwistnbQ78WZ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TwistnbQ78WZ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TwistnbQ78WZ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms