Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Syne1Q6ZWR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms