Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Syne2Q6ZWQ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Syne2Q6ZWQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms