Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AY358078Q6UY53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AY358078Q6UY53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms