Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp8b3Q6UQ17 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp8b3Q6UQ17 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8b3Q6UQ17 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8b3Q6UQ17 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8b3Q6UQ17 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8b3Q6UQ17 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms