Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casc1Q6TDU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Casc1Q6TDU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Casc1Q6TDU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms