Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx4Q6RUU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptx4Q6RUU0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx4Q6RUU0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptx4Q6RUU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptx4Q6RUU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptx4Q6RUU0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx4Q6RUU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx4Q6RUU0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms