Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Neil2Q6R2P8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Neil2Q6R2P8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Neil2Q6R2P8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms