Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trak1Q6PD31 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trak1Q6PD31 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trak1Q6PD31 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Trak1Q6PD31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trak1Q6PD31 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms