Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6PD19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6PD19 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q6PD19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q6PD19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q6PD19 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q6PD19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q6PD19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q6PD19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q6PD19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q6PD19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q6PD19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q6PD19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q6PD19 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Q6PD19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q6PD19 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q6PD19 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q6PD19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q6PD19 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6PD19 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6PD19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6PD19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q6PD19 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q6PD19 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q6PD19 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6PD19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6PD19 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6PD19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q6PD19 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6PD19 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6PD19 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6PD19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms