Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RbfaQ6P3B9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms