Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc4Q6P2L7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc4Q6P2L7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casc4Q6P2L7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc4Q6P2L7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc4Q6P2L7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc4Q6P2L7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms