Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig3Q6P1C6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig3Q6P1C6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig3Q6P1C6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 465.3 ms