Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l2Q6KAU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg16l2Q6KAU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l2Q6KAU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms