Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt87Q6IMF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt87Q6IMF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms