Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pram1Q6BCL1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pram1Q6BCL1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pram1Q6BCL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms