Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg9aQ68FE2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg9aQ68FE2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg9aQ68FE2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms