Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED7

Crtc1, CREB-regulated transcription coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc1Q68ED7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crtc1Q68ED7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crtc1Q68ED7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crtc1Q68ED7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms