Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CbarpQ66L44 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CbarpQ66L44 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CbarpQ66L44 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms