Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd180Q62192 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd180Q62192 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd180Q62192 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms