Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntn2Q61330 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn2Q61330 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn2Q61330 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn2Q61330 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms