Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2bQ61313 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfap2bQ61313 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfap2bQ61313 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms