Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mre11Q61216 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mre11Q61216 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms