Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtcfQ61164 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtcfQ61164 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms