Protein–RNA interactions for Protein: Q61120

Shc3, SHC-transforming protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc3Q61120 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc3Q61120 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc3Q61120 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc3Q61120 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc3Q61120 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc3Q61120 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc3Q61120 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc3Q61120 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms