Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp4Q61107 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbp4Q61107 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp4Q61107 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms