Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sin3aQ60520 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sin3aQ60520 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sin3aQ60520 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms