Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp13a4Q5XF90 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a4Q5XF90 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms