Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms