Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r195Q5SVD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms