Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tns3Q5SSZ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tns3Q5SSZ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tns3Q5SSZ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tns3Q5SSZ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms