Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme4Q5SSW2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psme4Q5SSW2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme4Q5SSW2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms