Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Rapgef6Q5NCJ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rapgef6Q5NCJ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rapgef6Q5NCJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms