Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc1Q5NCF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc1Q5NCF2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms