Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim58Q5NCC9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim58Q5NCC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms