Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb3Q571F5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spsb3Q571F5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb3Q571F5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb3Q571F5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms