Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxn3Q499D0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxn3Q499D0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms