Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam228bQ497Q6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms