Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil2Q3V3V9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms