Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls1Q3V0K9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls1Q3V0K9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls1Q3V0K9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms