Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbm44Q3V089 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms