Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm44Q3V089 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rbm44Q3V089 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbm44Q3V089 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbm44Q3V089 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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