Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX66

7420426K07Rik, RIKEN cDNA 7420426K07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7420426K07RikQ3UX66 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7420426K07RikQ3UX66 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
7420426K07RikQ3UX66 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7420426K07RikQ3UX66 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms