Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTC0

B020004J07Rik, RIKEN cDNA B020004J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004J07RikQ3UTC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020004J07RikQ3UTC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020004J07RikQ3UTC0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020004J07RikQ3UTC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms