Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec31aQ3UPL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec31aQ3UPL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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